En el año del centenario de su fundación, Atlas no podrá participar de la próxima edición de la Copa MX, debido a la pobre cantidad de puntos acumulados durante la última temporada de la Liga MX, en la que apenas acumuló 31 unidades de las 102 puestas en juego.
De acuerdo con el reglamento de la Liga MX, sólo los primeros 12 equipos mejor posicionados en Primera División (a excepción de los Campeones y Subcampeones de los torneos Apertura y Clausura, quienes obtienen el pase a Liga de Campeones de Concacaf), más 12 conjuntos invitados de la Liga de Ascenso MX, tendrán la posibilidad de pelear por el título de la Copa MX.
Desde 2012, año en que reinstauró el torneo copero, es la primera vez que el equipo rojinegro no participa de la competencia que otorga una plaza para jugar el repechaje de la Copa Libertadores.
Así quedaron los tres bombos con los participantes de la Copa MX, según Enrique Bonilla, presidente de Liga MX:
Bombo 1: León, América, Toluca, Morelia, Leones Negros, FC Juárez y Tapachula y Dorados
Bombo 2: Chivas, Puebla, Santos, Cruz Azul, Atlante, Lobos BUAP, Mineros y Alebrijes
Bombo 3: Querétaro, Murciélagos, Veracruz, Venados FC, Celaya, Jaguares, Coras y Tijuana