Debido a los hechos ocurridos en el Estadio Benito Juárez durante el partido entre Alebrijes y Chiapas de Copa MX, la Comisión Disciplinaria abrió una investigación en contra del equipo oaxaqueño.
A través de un comunicado publicado en la página de internet de la Femexfut, se menciona que "inició un procedimiento de investigación en contra del Club Alebrijes de Oaxaca debido a los hechos acontecidos el martes 2 de febrero de 2016 en la cancha del Estadio Benito Juárez por parte de algunos integrantes del grupo de animación local".
Al finalizar la Ida de la Llave 2, algunos aficionados ingresaron al campo y quemaron papeles dentro de la cancha del inmueble.
Tras esto, el presidente de Alebrijes, Javier San Román, aseguró que "actuaremos con firmeza de acuerdo con la Comisión Disciplinaria y con la liga para que estos hechos jamás vuelvan a ocurrir".